硝化细菌凡是玩水族的或多或少的都听到过，我这篇文章主要是给新人解释一下什么是硝化细菌和硝化系统，为什么要建立硝化系统，以及人们对于硝化系统的一些误解
一、硝化细菌及硝化系统
硝化细菌 ( nitrifying ) 是一种好氧自营性细菌，分解无机物，包括亚硝化细菌和硝化细菌。一般生活在有氧的水中或沙层中。鱼缸的话，主要生活在滤材上和水妖精上。
常见滤材：陶瓷环，玻璃环，生化棉
硝化细菌的存活条件：硝化细菌的存活需要水分，还需要很高的氧气。硝化细菌最适宜在在弱碱性的水中生活，在温度达到25℃左右时生长繁殖最快。硝化细菌生长速度较缓慢，其平均代时（即细菌繁殖一代所需要的时间）在10小时以上。这也是养水时间长的原因。
硝化细菌在氮循环水质净化过程中扮演着很重要的角色。
在硝化细菌和亚硝化细菌的作用下，可以将腐化菌分解食物残渣粪便等有机物产生的高毒的氨转化成低毒的硝酸盐，最后经反硝化细菌或者水生植物，将硝酸盐转化成氮气排出水体。
过程如下：
第一步：
水生生物的排泄物和食物残渣会被腐化菌分解转变为氨，而氨是有毒的。
第二步：
亚硝化细菌能把氨会转变为亚硝酸盐NO2-，反应式：2NH3＋3O2→2HNO2＋2H2O＋158kcal(660kJ)，亚硝酸盐虽然含较少的毒素，但仍对生物造成致命的毒害。
第三步：
硝化细菌又将亚硝酸盐氧化成硝酸盐。反应式：HNO2   1/2 O2 = HNO3，而这硝酸盐是低毒的，可通过换水或者水生植物吸收降低。
以上过程为一完整的硝化过程，一个强大的硝化系统，能够起到很好的生物过滤效果。
二、为什么要建立硝化系统
在一个封闭的水体环境里，过量的食物残渣和排泄物如果没有被及时清理出去的话，势必会被腐化菌分解成毒性很大的氨，往往新开的缸造成大面积的死鱼死虾，多半原因就是被氨毒死的。封闭的缸中能看见的污染物可以通过物理过滤除去，可是看不见摸不着的氨怎么去除呢？就要依靠硝化系统这个生化过滤了。滤材越多，硝化细菌数量越多，硝化系统越强大。
三、人们对硝化细菌的误解
水质清澈=硝化系统建立？？？
以上观点是不准确的，水清和硝化系统不应该是画等号的，水质浑浊一般是因为水体中有悬浮颗粒，也就是灰尘或者是粪便、垃圾，可加强物理过滤达到水清，足够数量的腐化菌也能够减少悬浮颗粒的数量。
硝化细菌只能够降低氨及亚硝酸盐的浓度，而不会分解垃圾。
四、硝化细菌制剂的使用
这条也许会得罪很多人，肯定也有错误的地方，欢迎大家讨论
首先说明一下市售的硝化细菌多半是光合细菌或者复合菌。
光合细菌属于异应性细菌，可以像腐化菌一样分解有机物，而不会降低氨及亚硝酸盐。
复合菌就比较好，除了有异应性细菌，也有硝化细菌等自营性细菌，几种细菌共同作用，能够更好的建立完整的硝化系统。
市售的纯硝化细菌又分为活菌和休眠菌，已知科迪硝化细菌是活菌，其他粉末或者液态的硝化细菌都属于休眠菌。
选择活菌的好处是除氨效果迅速，最适用于氨浓度过高的紧急情况。但是因活菌对氧气的要求十分严格。休眠菌的优点是能耐久藏，较不用担心失效的问题，但是因为由休眠菌变成活菌所需的活化时间可能需要数天之久，所以无法使用于紧急状况之处理，仅适用于日常的水质管理。
添加硝化细菌休眠菌能不能成活，能成活多少就要看缸中的水质了（参考存活条件）。
硝化细菌最好添加在滤材上。
最后，说一下硝化细菌的使用感受。
在一个NO2-很高的缸里，添加硝化细菌，百因美和德彩硝化细菌都是三天后起作用，NO2-基本上降到0，十元一瓶的液态硝化细菌（用了一次就扔了，忘记什么牌子了），添加一个星期后NO2-依然很高，怀疑就是纯的光合细菌，而不是硝化细菌。