硝化细菌, 选择
1、看有无生产日期。
正常液态的菌剂保质期都在一年左右。如果连生产日期都没有，购买时就要小心了。
2、看菌液是什么颜色。
硝化细菌菌体呈淡黄色，制成的硝化细菌制剂通常呈白色或淡黄色。如果呈黑色，则可能是硝化细菌死亡了，或是菌剂中含有的硫酸盐还原菌产生的硫化氢和水中的铁离子反应生成黑色的硫化亚铁的缘故。一些菌液呈红色或浅红色的菌剂通常不是硝化细菌而是光合细菌或其它制剂。
3、看是否区分淡、海水。
硝化细菌是一种有生命的微生物，需要特定的生存环境。众所周知，淡水鱼不能在海水中生存，海水鱼也不能在淡水中生存，硝化细菌也是如此。在自然界中存在着淡水型硝化细菌和海水型硝化细菌两种类型，不能混淆使用。如果相信一些产品上所说的淡、海水通用，大家想象一下突然把淡水鱼丢到海水里会是什么样的情形就会明白了。
4、闻菌液的气味。
通常硝化细菌无味或略带腥味，而不是臭的。如果硝化细菌菌剂发出非常难闻的臭味（类似臭鸡蛋的味道），那就是瓶中存在着硫化氢。硫化氢是一种对鱼类有害的物质，它是由硫酸盐还原菌在厌氧条件下，将水中的硫酸盐还原而产生的。而硝化细菌与硫酸盐还原菌相反，是好氧菌。在硫酸盐还原菌大量存在的环境中，必然导致硝化细菌生长和繁殖受到抑制，从而不能起到净化水质的作用，甚至对鱼类产生毒害
但是达到上面四条的就是好的硝化细菌了吗？非也。这只是硝化细菌的必要条件。即如果是真正的硝化细菌那么就一定应该满足上面的四条，但是反过来完全满足上面四条的，也不见得是真正的硝化细菌。但是这四条是一个最基本的标准。如果不满足这四条，那就不必要继续判断下去了。用户也就可以考虑其它品牌的产品了。
5、判断市售硝化细菌优劣的最直接也是最准确的方法就是测水族箱中的氨氮和NO2的含量。因为硝化细菌最大的作用就是去除水中对鱼有强烈毒害作用的氨氮和NO2。哪一种产品能在最短的时间清除水中的氨氮和NO2，那么无疑这就是效果最好的硝化细菌。因为越快清除氨氮及NO2，鱼就能越早的免受氨毒伤害，就越能尽快的为鱼创造出一个适宜生存的健康环境。
但是此条在实际操作中存在一些技术性问题，并非每个鱼友都能做到。这就需要通过其它的一些观察来进行判断。比如说不少鱼友都有过在换水或是开缸初始时死鱼的情况。如果是效果好的活菌，在换水或开缸的同时加入就不会出现这种情况，具体原因可以参看我其它两篇文章《水族箱中水体的氮循环》和《为什么新开的缸养鱼愿意死－新池（缸）症候群》。还有就是，水族箱中如果有异味的话，加入菌，并给氧，应该在24小时左右就应该清除异味的。
６、在介绍正确的判断方法的同时不得不提几种常见的错误认识。
不少人经常把水清不清作为对硝化细菌好坏的一个判断，其实这是不科学的。水不清可由多种原因造成。我会在其它的文章里面单独进行介绍。现在水族界有一种简单的办法就是添加净水剂，以改善水质浑浊的现象。当然这是一种治标不治本的方法，即不管你是何种原因造成的浑浊，净水剂一倒进去，问题就解决了。所以把净水剂的效果硬要安到硝化细菌身上，这纯粹是对硝化细菌的误解。因为硝化细菌和净水剂所起的作用是完全不同的。净水剂是靠絮凝作用在很短的时间内，将悬浮颗粒吸附过来形成比较大的颗粒而沉淀，然后由水泵将其抽到过滤器中，达到澄清水质的作用。这样的水虽然是清的，可是里面的氨氮却依然存在，对鱼的毒害作用依然存在，鱼该得病还得病。而硝化细菌的作用却是将水中有毒的氨氮清除掉的，这样的水即使不那么清，但是鱼却不会因为氨中毒而得病或死亡。
在实际使用过程中感觉有些人说干粉型硝化细菌比较好用，我不知道他们是用什么方法检测的，但是在调查时我听过一个鱼友是这么形容一个品牌的干粉硝化细菌的（而且这个牌子好象还很有名），“非常好使，头一天晚上放进去，第二早上一看水象镜子一样。”给人的第一感觉怎么听怎么不象硝化细菌，反倒象是净水效果稍慢一些的净水剂。
但是硝化细菌有没有清水的作用呢？现在还没有找到科学依据，但是在使用过程中发现的确有时候加入硝化细菌后水会比较清一些，但这也只是硝化细菌的附属作用，决不是使用硝化细菌的目的。而且这个时间会很长。最快也要三天之后，甚至七天，甚至更长。如果那一种硝化细菌加入到水中，水很快就变清了，那么可以肯定它决不是单纯的硝化细菌这种生物制剂了，肯定是添加了某些净水化学成分。它的名字也应该改成“硝化细菌净水剂”了。
还有的人说硝化细菌应该越臭越好，如果不臭的就不是硝化细菌。毫无疑问这肯定是不正确的了。因为硝化细菌本身是不臭的，那么臭从何来？很显然一定是制剂中有其它的杂质。在实际调查中就发现过有鱼友使用臭菌生缸壁虫的现象。可以肯定的是臭的菌一定是不好的，但是不臭的菌却不一定全是好的。在一个市场上看到过一种不臭的菌，但是经销商和厂家直接就告诉你了，得七、八天之后才能起作用，很显然这不是活菌制剂，具体是什么，在这里面就不好说了。
所以要想达到添加硝化细菌的目的，也就是通过生物增强手段，使硝化细菌迅速出现在水族箱中，降除氨氮，并形成优势菌群，抑制病原菌的生长，最好的办法就是选择不臭的活菌