硝化菌是一种好氧性细菌，包括亚硝酸菌和硝酸菌。生活在有氧的水中或砂层中，在氮循环水质净化中扮演着很重要的角色。硝化菌最适宜的温度是25℃，这正是大多数热带鱼的生存温度。消化作用从5℃—35℃都可以进行，在25℃是最适宜的，所以不要认为冬天硝化菌就不工作了，他们只是活性降低而已。硝化菌不喜光，如果有条件最好制造全黑的环境，这不是必需条件，有最好，没有也行。硝化菌会形成菌膜，会吸附在固体表面进行繁殖，所以在鱼缸里我们需要为硝化菌提供足够的场所。
     硝化菌的存活条件：硝化细菌的生存需要水分。还需要很高的氧气。硝化细菌最适宜在弱碱性的水中生活，在温度达到25℃左右时生长速度最快。它的繁殖不遵循分离定律和自由组合定律。
     如何才能提高消化细菌的数量呢？为消化细菌塑造一个理想的繁殖场所是最根本的解决办法。怎么说呢？原来消化细菌在繁殖过程中，有附着于固定物外表的倾向，若能在池水中，安置若干多表面积的固定物供其附着，它就能迅速地附着在这些固定物的表面，并开始增值。
     添加硝化细菌制剂也是另一种可行的办法。尤其实在做水质检发现水中氯浓度偏高时，采用这种方法最有效率。但这种方法只是治标方法，不是治本方法 ，因为这些制剂在水中活化成为活菌之后，他们仍然多属无壳五牛，在池水中无法增值，甚至因环境不适而逐渐死亡，故必定期添加才能发挥其效果。
   在使用消化细菌时要注意：硝化细菌与杀菌药应前后分开使用，注意杀菌药的药效期以及药物残留与分解时间，必要时可以使用活性炭吸附、缩短等待时间。另外硝化细菌可以和盐搭配使用，因为硝化细菌是广盐性的，但盐的浓度不要太大，否则会影响硝化细菌的生物活性。