取样菌在完全无机的含氨营养试液作除氨效率及速度的测试，若样菌有明显的除氨效率及速度，即暗示它可能是硝化细菌，理由是在几乎完全无机环境中，以及又有丰富的氨源之情况下，似乎只有硝化细菌能适其中，并发挥除氨功能。
    硝化细菌的作用绝对不是单纯的净水，他是一个水族生态的关键。刚建立的新缸并不存在这些有益的细菌。当你把买来的硝化菌倒在生化环上的时候，细菌开始在里面繁殖，这是一种有益菌，通过他建立一种生物过滤系统，以自然分解水中的底质和有害物质。当然这需要一段的时间，让这些细菌繁殖，直到他足以处理鱼儿的排泄物。
    而这些细菌的繁殖速度，草缸要比裸缸相对快的多。裸缸必须有良好的物理过滤，然后通过硝化细菌在滤材中的繁殖，再起到生物过滤的效果。一旦生物过滤建立好了，才真正开始了你的氮循环。这样一个氮循环的过程有时需要几周，甚至更长的时间。你们可能有这样一种相同的经历：
    第一天，放入闯缸鱼，此时氨和亚硝酸盐浓度为0，水是非常清澈的，象水晶般；
    第3天，水开始发白，氨的浓度马上升到一个危险水平，硝化细菌开始繁殖生长，鱼只开始窘迫，拒食。
    第5天，氨的浓度达到高峰，硝化细菌开始把氨转换为亚硝酸盐，鱼出现明显不适，有些鱼可能在这一时间死去。
    第8天，氨被转换为了亚硝酸盐，亚硝酸盐浓度上升，鱼的状态开始好转。
    到了第14天，亚硝酸盐的浓度又开始上升到高峰，，鱼再次陷入窘迫，某些强壮的鱼，可以挺过这一时期。
    第20天左右，亚硝酸盐开始下降，氮循环第2阶段开始，鱼只状态好转，水质也开始稳定。
    第25天亚硝酸盐被转换成硝酸盐。亚硝酸盐的浓度迅速降低。
    第30天，氨 和亚硝酸盐已经检测不出，水族箱完成了氮循环，你可以换掉一部分水，然后放入你想要的鱼了。
    还有你的过滤系统，滤材可以换成：过滤棉/生化球/石英环/活性炭/过滤棉。甚至滤材还可以再简单点：过滤棉/生化棉 /石英环，就可以了。