养鱼是一门科学。随着科学养鱼理念的普及，人们对鱼缸生态系统、生化过滤、生物滤材、硝化菌等越来越重视，都在努力的为鱼儿营造一个舒适的生活环境，使其能把最美丽的一面展现给我们。但是在论坛待久了，发现很多鱼友对硝化菌的认识存在误区，我给大家举两个例子：
例一：为什么我清洗滤材后水就变混了？
答：清洗滤材后硝化系统受到破坏，硝化菌大量死亡，所以水会变混。
例二：为什么我开缸后水一直比较混浊不清呢？
答：这是因为硝化系统还不健全，硝化菌的数量比较少，所以水不清，等硝化系统健全后水自然就清澈了。
以上的两个案例都是在讲水的澄清度与硝化系统（硝化菌）的关系，如果您认为以上的回答都是正确的话，那么请一定把这篇文章读完，因为这两个答案都是错误的。
其实应该很少有人能说清楚什么是硝化系统，因为在百度上都查不到硝化系统的定义，所以这个概念比较模糊，因此也就有了很多对硝化系统的错误认识，那么硝化系统应该怎么定义、硝化系统的组成和作用是什么？我先讲一下这个问题。
先看一下我给硝化系统的定义：以生物滤材做为载体培养硝化菌的水循环过滤系统叫做硝化系统。从这个定义可以看出硝化系统是由水泵、生物滤材和硝化菌这三大要素构成。其实硝化系统就是一个培养硝化菌的平台，生物滤材给硝化菌提供了栖息繁殖的场所，水循环系统为硝化菌带来了氧气和食物（氨和亚硝酸盐），这就是硝化系统，它的最终目的是培养硝化菌来清除水中的毒素。
理解了什么是硝化系统，再来看一下它和水的澄清度的关系。大家都知道硝化系统（硝化菌）的功能是净水，但是很多人都错误的理解了净水的含义，把净水理解成了清水，总是把水的清澈与否和硝化系统（硝化菌）挂钩，所以就有了上面的这两个错误答案。
硝化菌的作用是去除水中的毒素（氨和亚硝酸盐）起到净化水质的作用，而不是清洁水体。如果氨和亚硝酸盐的存在会引起水混浊，硝化菌将它们去除后水就会变的清澈，如果真的是这样的话，硝化系统（硝化菌）就具有清水功能，但会是这样吗？
学过初中化学的人都知道氨和亚硝酸盐是无机物，它们的存在并不改变水的澄清度，就像盐撒进水里不会使水变混一个道理。水绝不会因为有了氨和亚硝酸盐的存在而变的混浊，也不会随着氨和亚硝酸盐的去除而变的清澈。因此，硝化系统（硝化菌）和水的清澈混浊没有关系。
上面这段话一定会对不少鱼友的知识体系造成冲击，我经历过很多次这样的辩论，当我提出硝化菌和水的清澈混浊没有关系的理论时，很多人一开始是坚决不认同的，但是经过细致的讨论，绝大多数鱼友都会认同这个观点。其实要说清楚水清与硝化菌的关系不是那么容易的，需要具备一定的专业知识，下面我会充分的论证我的观点。
我们鱼缸的水为什么会混浊，这个问题我在“生物性混浊的危害及控制”这篇文章里已经充分的论述过了。生物性浑浊是鱼缸水浑浊的最主要形式，表现为水混沌不清、雾朦朦的，其实这是一个物理现象，叫做“丁达尔效应”。细菌很小我们肉眼是看不到的，但是当它大量繁殖的时候，就会产生乳光，改变水的折光率，使光发生散射，造成水的澄明度下降，我们看到水的白浊就是细菌大量繁殖后改变了光的反射造成的结果。
鱼便残饵等过多的有机物会引发异营菌的大量繁殖，从而产生“丁达尔效应”造成生物性浑浊。要想控制这种生物性混浊有两条途经：1、杀灭过度繁殖的异营菌，2、清除过多的有机物。那么我们再来看一下硝化系统（硝化菌）具有这样的功能吗？
1、硝化系统（硝化菌）能杀菌吗？答案是绝无可能。硝化系统是用来培养硝化菌的，硝化菌分解的是毒素，毒素是异营菌的代谢产物，通俗的说就是异营菌的粪便，硝化菌分解的是异营菌的粪便而不是异营菌本身，所以不会对异营菌造成任何威胁，没有杀菌功能。可能有人会问硝化系统会不会除了培养硝化菌之外还能培养一些能杀菌的细菌呢?答案也是否定的。因为我是学微生物的，我知道自然界中存在一些原生生物以细菌为食比如噬菌体，还有很多细菌会分泌抗生素、溶菌酶来抑止其他细菌的生长，但是它们和硝化系统没有关系，它们不需要依附于生物滤材来生长繁殖，也不需要水循环系统，也不是硝化系统培养出来的，所以和硝化系统没有任何关系。